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Precondicionamiento con factorizaciones incompletas Miguel Vargas-Félix [email protected] http://www.cimat.mx/~miguelvargas CIMAT, September 29, 2015 1/24 Número de condición El número de condición κ de una matriz A no singular, para una norma ∥⋅∥ está dado por κ(A)=∥A∥⋅∥A−1∥. Para la norma ∥⋅∥2, κ(A)=∥A∥⋅∥A−1∥= σ max ( A) , σ min (A) donde σ son los valores singulares de la matriz. Para una matriz A simétrica positiva definida, λ max (A) , κ(A)= λ min (A ) donde λ son los eigenvalores de A. http://www.cimat.mx/~miguelvargas 2/24 El número de condición indica que tan sensible es una función a pequeños cambios en la entrada. Así, matrices con un número de condición cercano a 1 se dicen que están bien condicionadas. Un sistema de ecuaciones A x=b es considerado bien condicionado si un pequeño cambio en los valores de A o un pequeño cambio en b resulta en un pequeño cambio en x. Un sistema de ecuaciones A x=b es considerado mal condicionado si un pequeño cambio en los valores de A o un pequeño cambio en b resulta en un cambio grande en x. Al reducir el número de condición de un sistema, se puede incrementar la velocidad de convergencia del gradiente conjugado. http://www.cimat.mx/~miguelvargas 3/24 Gradiente conjugado precondicionado Entonces, en vez de resolver el problema A x−b=0, se resuelve el problema −1 M ( A x−b )=0, −1 con M una matriz cuadrada, la cual recibe el nombre de precondicionador. −1 −1 −1 El mejor precondicionador sería claro M =A , así x=M b, y el gradiente conjugado convergiría en un paso. −1 Al igual que la matriz A, el precondicionador M tiene que ser simétrico positivo definido. −1 Hay dos tipos de precondicionadores, implícitos M y explícitos M . −1 En algunos casos es costoso calcular M , en general se utilizan precondicionadores con inversas fáciles de calcular o precondicionadores implicitos que se puedan factorizar. http://www.cimat.mx/~miguelvargas 4/24 El algoritmo es el siguiente: entrada: A , x 0, b,ε r 0 ← A x0 −b −1 q0 ← M r0 p0 ← −q 0 k ← 0 mientras ∥r k∥>ε w ← A pk T rk qk αk ← T pk w x k +1 ← x k +α k p k r k +1 ← r k +α w −1 q k +1 ← M r k +1, o resolver M q k + 1 ← r k +1 T r k +1 q k +1 βk ← r Tk q k p k +1 ← −q k +1 +βk +1 p k k ← k +1 Nótese que ahora el algoritmo require aplicar el precondicionador en cada paso. http://www.cimat.mx/~miguelvargas 5/24 Precondicionador Cholesky incompleto Éste consiste en tener un precondicionador T M=H t D H t , dónde H t es una matriz triangular inferior rala que tiene una estructura similar a la factorización Cholesky de A. El entero t indicará el nivel de truncamiento. La estructura de H 0 será igual a la estructura de la parte triangular inferior de A. La estructura de H n será igual a la estructura de L (factorización Cholesky de A). Los valores de H t se llenarán utilizando la fórmulas de la factorización Cholesky, así H i i =1, ( ) j−1 1 H i j= Ai j−∑ H i k H j k D k , para i> j Dj k =1 j−1 D j = A j j − ∑ H 2j k D k . k =1 Veamos un ejemplo, para una matriz A ∈ℝ http://www.cimat.mx/~miguelvargas 424×424 , la estructura de H t sería... 6/24 A= η ( A )=2456 http://www.cimat.mx/~miguelvargas 7/24 H 0= η ( H0 )=1436 http://www.cimat.mx/~miguelvargas 8/24 H5 = η ( H5 )=1767 http://www.cimat.mx/~miguelvargas 9/24 H10 = η ( H10 )=2196 http://www.cimat.mx/~miguelvargas 10/24 H 20 = η ( H 20 )=5262 http://www.cimat.mx/~miguelvargas 11/24 H 30= η ( H30 )=6779 http://www.cimat.mx/~miguelvargas 12/24 H 40 = η ( H 40 )=7012 http://www.cimat.mx/~miguelvargas 13/24 L= η ( L )=7012 http://www.cimat.mx/~miguelvargas 14/24 Factorización Cholesky simbólica truncada Para una matriz rala A, definamos a i ≝ { k >i ∣ A i k ≠0 }, i=1…n, como el conjunto de los índices de los elementos no nulos del renglón i de la parte estrictamente triangular superior de A. T De forma análoga definimos para la matriz H t , los conjuntos hi ≝ { k >i ∣ H i k ≠0 }, i=1…n. Para la matriz ejemplo siguiente, el conjuto a2 contendrá { 3, 4 }; el conjunto h2 contendrá { 3, 4, 6 }. ( A1 1 A2 1 A= A1 2 A2 2 A3 2 A4 2 A1 6 A2 3 A3 3 A2 4 A3 5 A4 4 A5 3 A6 1 a 2= {3, 4 } http://www.cimat.mx/~miguelvargas A5 5 A5 6 A6 5 A6 6 ) ( T Ht = H 11 H 12 H 22 H 23 H 24 H 33 H34 H 44 H 35 H 45 H 55 H 16 H 26 H 36 H 46 H 56 H 66 ) h2={ 3, 4, 6 } 15/24 T Requeriremos de conjuntos r i que serán usados para registrar las columnas de H t cuyas estructuras T afectarán al renglón i de H t . for i ← 1, 2,…, n · ri ← ∅ for i ← 1, 2,…, n · hi ← a i · for each j∈r i · · hi ← hi ∪{x∈h j∣x−iε w ← A pk T rk qk αk ← T pk w x k +1 ← x k +α k p k r k +1 ← r k +α w T resolver H t D Ht q k + 1=r k +1 T r k +1 q k +1 βk ← r Tk q k p k +1 ← −q k +1 +βk +1 p k k ← k +1 http://www.cimat.mx/~miguelvargas 18/24 Pero hay un problema... Puede suceder que el precondicionador no sea SPD. Para evitar esto utilizaremos el algoritmo de Munksgaard [Munk80], que consiste en dos estrategias: 1. Perturbar la diagonal de A con un factor α, j−1 D j j =α A j j −∑ H 2j k D k , k =1 esto asegurará que el precondicionador sea SPD, el valor de α se puede encontrar por prueba y error. 2. Perturbar los pivotes para mejorar la estabilidad si éstos son negativos o cecanos a cero, si D j j ≤u { a j k∣ , entonces D j j = ∣ ∑ ( ) k≠ j ∑ ∣a j k∣ k≠ j 1 ∑ ∣a j k∣≠0 k≠ j . si ∑ ∣a j k∣=0 si k≠ j Un valor de u adecuado es 0.01. http://www.cimat.mx/~miguelvargas 19/24 Algunos resultados Problem Dimension Nodes Elements Element type Variables nnz(A) Tolerance Arc 2 50,805 49,972 Quadrilateral 101,610 1’808,980 1x10-5 45.0 39.1 40.0 35.0 30.0 23.5 25.0 18.6 Time [s] 20.0 18.6 17.7 18.9 14.4 15.0 10.0 19.6 5.6 5.5 5.0 0.0 http://www.cimat.mx/~miguelvargas 20/24 Problem Dimension Nodes Elements Element type Variables nnz(A) Tolerance Solver Cholesky CG CG + Jacobi CG + Cholesky [0] CG + Cholesky [1] CG + Cholesky [10] CG + Cholesky [100] CG + Cholesky [1000] CG + Cholesky [10000] CG + Cholesky [100000] http://www.cimat.mx/~miguelvargas Arc 2 50,805 49,972 Quadrilateral 101,610 1’808,980 1x10-5 Time [s] 5.6 39.1 23.5 18.6 19.6 18.6 17.7 18.9 14.4 5.5 Steps 7723 4070 1519 1519 1482 1162 708 308 1 nnz(H) 6911289 954741 954741 990125 1572311 3434219 5715237 6911289 Memory 215100454 40768170 40768170 71330422 71330422 72179638 86152102 130837894 185582326 214287574 Memory 100.0% 19.0% 19.0% 33.2% 33.2% 33.6% 40.1% 60.8% 86.3% 99.6% 21/24 ¿Paralelizable? En cada paso tenemos que resolver el sistema T H t D Ht q k + 1=r k +1. T Hagamos d=H t q k +1 y c=D d, entonces tendremos tres sistemas de ecuaciones T H t c=r k +1, D d=c, H t q k +1=d. Primero tenemos que resolver H t c=r k +1 para c haciendo una sustitución hacia adelante con ( i−1 ) 1 ci = r i −∑ H i k c k . Hii k =1 Después resolver D d=c, para obtener d. T Finalmente, resolver H t q k +1=d para q k +1 sustituyendo hacia atrás con ( n ) 1 T qi= T d i − ∑ H i k q k . H ii k =i+1 Es muy difícil paralelizar esta sustitución [Heat91 pp454-455] debido a que existe una dependencia secuencial entre las variables. http://www.cimat.mx/~miguelvargas 22/24 ¿Preguntas? [email protected] http://www.cimat.mx/~miguelvargas 23/24 Referencias [Benz02] M. Benzi. Preconditioning Techniques for Large Linear Systems: A Survey. Journal of Computational Physics, Vol. 182, pp. 418-477. 2002. [Golu96] G. H. Golub, C. F. Van Loan. Matrix Computations. Third edidion. The Johns Hopkins University Press. 1996. [Heat91] M T. Heath, E. Ng, B. W. Peyton. Parallel Algorithms for Sparse Linear Systems. SIAM Review, Vol. 33, No. 3, pp. 420-460. 1991. [Meie94] U. Meier-Yang. Preconditioned conjugate gradient-like methods for nonsymmetric linear systems. University of Illinois. 1992 [Munk80] N. Munksgaard. Solving sparse symmetric sets of linear equations by preconditioned conjugate gradients. ACM Transactions on Mathematical Software, Vol 6-2, pp. 206219. 1980 [Noce06] J. Nocedal, S. J. Wright. Numerical Optimization, Springer. 2006. [Saad03] Y. Saad. Iterative Methods for Sparse Linear Systems. SIAM, 2003. http://www.cimat.mx/~miguelvargas 24/24