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Soly Santiago Pérez Dirección Xeral de Innovación e Xestión da Saúde Pública Junio 2011
Epidat: programa para análisis estadístico y epidemiológico de datos. Versión 3.1
Índice
1. ¿Qué es Epidat? 2. Objetivos de Epidat 3. Características de Epidat 3.1 – Entorno general – Contenido – Ayuda 4. Ejemplos 5. Resumen
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1. ¿Qué es Epidat?
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1. ¿Qué es Epidat?
• Análisis epidemiológico y estadístico de datos • No gestiona bases de datos • Libre distribución
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1. ¿Qué es Epidat? Trayectoria del programa
Epidat 1.0
Diciembre 1994
Epidat 2.0
Junio 1997
Epidat 2.1
Junio 1998
http://dxsp.sergas.es 6
Epidat 3.0
Marzo 2004
Epidat 3.1
Enero 2006
Epidat 4.0
Abril 2011
2. Objetivos de Epidat
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2. Objetivos
• Aportar una herramienta de manejo sencillo y de utilidad para el análisis estadístico y epidemiológico de datos. • Apoyar y facilitar la docencia en epidemiología y estadística. • Fortalecer la capacidad analítica de los profesionales. • Servir como fuente para la formación autodidacta en zonas escogidas de la estadística aplicada a la epidemiología.
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3. Características de Epidat 3.1
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3. Características de Epidat 3.1
ENTORNO GENERAL CONTENIDO AYUDA IDIOMA
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• • • •
Español Gallego Portugués Inglés
3. Características de Epidat 3.1 Entorno general DISEÑO Entorno habitual de Microsoft Office, con barras de menús y herramientas
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3. Características de Epidat 3.1 Entorno general MENU METODOS
12 módulos 91 ventanas
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3. Características de Epidat 3.1 Entorno general ENTRADA DE DATOS • Entrada manual • Entrada automática: Excel, Access, Dbase
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3. Características de Epidat 3.1 Entorno general RESULTADOS Cuadro de texto en cada módulo
Calcular
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3. Características de Epidat 3.1 Entorno general RESULTADOS • Ventana de resultados generales • Los resultados pueden guardarse en formato rtf
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3. Características de Epidat 3.1 Contenido
1. Ajuste de tasas 2. Demografía 3. Muestreo 4. Distribuciones de probabilidad 5. Concordancia y consistencia 6. Pruebas diagnósticas 7. Tablas de contingencia 8. Inferencia sobre parámetros 9. Análisis bayesiano 10. Vigilancia en salud pública 11. Metaanálisis 12. Jerarquización 16
Epidat 4.0
3. Características de Epidat 3.1 Ayuda • Enfoque didáctico y crítico, incluyendo fundamentos estadísticos y epidemiológicos. • Disponible en formato pdf en la web de descarga del programa.
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4. Ejemplos
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4. Ejemplos
1. Ajuste de tasas 2. Demografía 3. Muestreo 4. Distribuciones de probabilidad 5. Concordancia y consistencia 6. Pruebas diagnósticas 7. Tablas de contingencia 8. Inferencia sobre parámetros 9. Análisis bayesiano 10. Vigilancia en salud pública 11. Metaanálisis 12. Jerarquización 19
4. Ejemplos
Pruebas diagnósticas • Pruebas simples • Pruebas múltiples • Prueba de referencia imperfecta • Curvas ROC • Simples • Comparación de curvas • Curva de Lorenz
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4. Ejemplos
Pruebas diagnósticas
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4. Ejemplos
Nivel de confianza:
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Pruebas diagnósticas
95,0%
Prueba diagnóstica -------------------Positivo Negativo -------------------Total
Prueba de referencia Enfermos Sanos Total --------- --------- --------45 6 51 2 28 30 --------- --------- --------47 34 81
------------------------Sensibilidad (%) Especificidad (%) Índice de validez (%) Valor predictivo + (%) Valor predictivo - (%) Prevalencia (%)
Valor ---------95,74 82,35 90,12 88,24 93,33 58,02
Índice de Youden Razón de verosimilitud + Razón de verosimilitud -
0,78 5,43 0,05
IC (95%) -------------------------88,91 100,00 68,07 96,64 83,01 97,24 78,41 98,06 82,74 100,00 46,66 69,39
0,64 2,62 0,01
0,92 11,24 0,20
4. Ejemplos
Pruebas diagnósticas
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4. Ejemplos
Número de categorías: Nivel de confianza:
Área ROC ---------0,8941
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EE ---------0,0258 0,0274
4 95,0%
Pruebas diagnósticas
IC(95%) ------------------------0,8435 0,9446 0,8404 0,9477
Delong Hanley & McNeil
4. Ejemplos
Tablas de contingencia Exposición‐enfermedad • Tablas 2×2 • Simples • Estratificadas • Tablas 2×N • Simples • Estratificadas Tablas generales • Tablas M×N • Regresión logística 25
4. Ejemplos
Tablas de contingencia
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4. Ejemplos
Tipo de estudio : Cohortes Tipo de datos : Incidencia acumulada Nivel de confianza: 95,0%
Tablas de contingencia
Tabla -----------Expuestos No expuestos -----------Total
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Enfermos -------202 81 -------283
Sanos -------2014 2811 -------4825
Total -------2216 2892 -------5108
---------------------------------------Riesgo en expuestos Riesgo en no expuestos Riesgo relativo Diferencia de riesgos Odds ratio
Estimación ---------0,091155 0,028008 3,254579 0,063147 3,480709
---------------------------------------Fracción atribuible en expuestos Fracción atribuible poblacional
---------0,692741 0,494465
IC(95,0%) --------- --------2,530224 4,186305 0,049739 0,076555 2,672989 4,532505 2,674775 4,529406 --------- --------0,604778 0,761126 0,393302 0,578760
Prueba Ji-cuadrado de asociación ---------------------------------------Sin corrección Corrección de Yates
Estadístico --------------95,5960 94,3932
Valor p --------0,0000 0,0000
4. Ejemplos
Inferencia sobre parámetros • Una población • Media • Proporción • Percentiles • Correlación • Recuento • Tasa de incidencia • Dos poblaciones • Medias independientes • Medias emparejadas • Proporciones independientes • Proporciones emparejadas • Tasas de incidencia 28
4. Ejemplos
Inferencia sobre parámetros
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4. Ejemplos
-------------------Media Desviación estándar Tamaño de muestra
Inferencia sobre parámetros
Muestra 1 ---------25,570 3,940 788
Muestra 2 ---------27,070 3,940 624
Prueba de comparación de varianzas Estadístico F -----------------1,0000
gl numerador --------------787
gl denominador --------------623
Diferencia de medias -------------------1,500
Varianzas ---------Iguales Distintas
IC (95,0%) ---------------------1,086 1,914 1,086 1,914
Prueba de comparación de medias Varianzas Estadístico t ----------------------------------Iguales 7,1045 Distintas 7,1045 30
Valor p ------0,9977
gl Valor p ------- ------1410 0,0000 1336 0,0000
4. Ejemplos
Meta‐análisis • • • •
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Odds ratio Riesgo relativo Diferencia de riesgos Diferencia estandarizada de medias
4. Ejemplos
Meta‐análisis
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4. Ejemplos
Meta‐análisis RESULTADOS INDIVIDUALES Y COMBINADOS Estudio ---------------------MCR-1 CDP MRC-2 GASP PARIS AMIS ISIS-2 ---------------------Efectos fijos Efectos aleatorios
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Año ---1980 1982 1984 1986 1988 1990 1992 ----
n -----1239 1529 1682 626 1216 4524 17187 -----28003 28003
OR -----1,3894 1,4689 1,2455 1,2488 1,2529 0,8828 1,1174 -----1,1149 1,1412
IC(95,0%) ----------0,9440 2,0451 0,9870 2,1863 0,9408 1,6489 0,7584 2,0565 0,8674 1,8097 0,7284 1,0699 1,0355 1,2057 ----------1,0448 1,1898 1,0084 1,2915
Pesos(%) E. fijos E. al. ------------2,8235 8,2123 2,6677 7,8451 5,3594 13,2288 1,6957 5,3570 3,1200 8,8893 11,4199 20,7005 72,9137 35,7669 -------------
4. Ejemplos
Meta‐análisis
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5. Resumen
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5. Resumen
• Epidat 3.1 es un programa de libre distribución desarrollado por instituciones públicas. • Está orientado al tratamiento de datos tabulados. • No permite la gestión de bases de datos. • Contiene técnicas específicas de epidemiología. • El manejo del programa es sencillo. • La ayuda es un elemento distintivo del programa. Soporte a usuarios:
[email protected] 881 54 67 59 36